สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์กำแพงเพชร ได้จัดตั้งขึ้นตามโครงการบริหารการเงินการบัญชีของสถาบันเกษตรกร เมื่อวันที่ 1 กรกฎาคม พ.ศ. 2526 โดยครั้งแรกใช้ชื่อว่า "สำนักงานตรวจสอบกิจการสถาบันเกษตรกรจังหวัดกำแพงเพชร "ต่อมาปี พ.ศ. 2527 จึงใช้ชื่อว่า "สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์กำแพงเพชร "อยู่ในการกำกับดูแลของสำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์ภูมิภาคที่ 3 ( นครสวรรค์ ) กองตรวจบัญชีที่ 1 กรมตรวจบัญชีสหกรณ์ ในระยะแรก ต้องเช่าอาคารของเอกชนเป็นที่ตั้งสำนักงาน จนกระทั่ง